新疆农垦科学院农田水利与土壤肥料研究所（简称水土所）是新疆兵团唯一从事节水灌溉、土壤改良、肥料研发使用和农化分析的专业研究所，现有科技人员18人，其中研究员3人，副研究员6人，助理研究员9人；享受政府津贴3人，省部级有突出贡献优秀专家1人，兵团学术带头人2人。重点学科有节水灌溉、土壤改良、科学施肥，是“国家节水灌溉工程技术研究中心（新疆）”技术依托单位，“国家节水灌溉（北京）工程技术研究中心”试验基地。

  承担国家“863”节水项目及一批国家、自治区和兵团重大科技攻关项目，取得成果60多项，部分成果达国际先进或国内领先水平，获国家科技进步奖二等奖2个，三等奖2个，省部级一等奖3个，二等奖14项。在国内外学术刊物上发表论文160多篇，撰写出版《精准灌溉》、《精准施肥》、《新疆垦区盐碱地改良》、《棉花科学施肥与棉田培肥》等专著。研发出兵团首个“棉花平衡施肥专家咨询服务系统”，已发展为单机版、网络版“FertGIS滴灌平衡施肥专家决策系统”，可提供配套技术服务；开展复混肥、各种作物专用肥、微肥的研发和测土配方施肥、农化服务，承担测试分析、人员培训和化验室规划等工作。