新疆农垦科学院作物研究所是新疆农垦科学院最早成立的研究机构。作物研究所现设有小麦、玉米/饲料、大豆/籽瓜、向日葵、特种经济作物、耕作栽培等6个研究室以及新疆农垦科学院农业科技开发部和农业科研试验站2个部门。现有职工52人，其中，国务院特贴专家2名、农业部有突出贡献中青年专家1名，兵团学术带头人3名。拥有设备先进“谷物品质与遗传改良”兵团重点实验室，具备优越的作物育种和栽培研究以及作物试验、检测和种子加工、贮藏条件，已成为兵团粮油作物育种基地以及国家、自治区粮油作物新品种区试和生产示范的试验基地。并且是国家现代农业产业体系向日葵育种研究室和大豆综合试验站技术依托单位。

  建所五十年来，作物研究所先后承担国家及省部级科研项目150多项，取得科研成果100多项，发表科研论文250多篇，编写专著和教材5部，先后有40多项科研成果获奖，其中国家科技进步三等奖1项，全国科技大会一等奖1项，农业部农牧渔业丰收一等奖1项、二等奖2项；自治区科技进步一等奖1项、二等奖1项、三等奖5项、四等奖3项；兵团科技进步一等奖5项、二等奖11项、三等奖8项，新疆农垦科学院科技进步特等奖1项、一等奖3项、二等奖4项、三等奖1项，为维护新疆、兵团粮食安全，提高油料生产水平，促进团场增效、职工增收做出了突出贡献！